採種及林木種子貯藏中心

(一)採種：

由林業保育署所屬各分署依照所需林木種子，每年約採取1,000公升以上，除供一般造林育苗種子外，並用於平地景觀、陸域關注區生態復育造林、崩塌地復育造林，樹種為：台灣肖楠、台灣杉、台灣櫸、木荷、青楓、台灣紅榨槭、台灣赤楊、楓香、光臘樹等數10種，為採集適合平地及陸域關注區生態復育造林、海岸地區造林樹種之種子，採種之樹種有海檬果、刺葉桂櫻、台灣海棗、苦林盤、厚葉石斑木、朴樹、黃槿、水黃皮、椬梧、草海桐、台灣梭羅木、台灣紅豆樹等數10種。

本分署於1968－1971年間，在「聯合國發展方案中華民國林業及森林工業計劃」指導及林業試驗所協助下，於57年起陸續建立有台灣二葉松、香杉、台灣肖楠及台灣杉等四種台灣重要原生造林樹種之種子園,其中台灣二葉松與香杉種子園已開花結實，（其中香杉及台灣肖楠並已建造有後裔試驗林），可提供已知種源、容易採取之林木種子供大面積造林用，為台灣重要之林木育種工作之一，該種子園除可供生產供造林用之大量優質種子並兼具有種源保育之功能。

（二）林木種子貯藏中心

林業保育署林木種子採取，視樹種（母樹）當年結實情形、庫存量及各分署年度育苗需求，編列採種及即播型種子育苗計畫，種子採取完成驗收後，需貯藏之種子，依制式貯存袋送本分署林木種子貯藏中心貯存，貯藏之林木種子，除林業保育署各分署、學術、研究單位外，不對外提供。
林木種子貯藏中心冷藏（凍）庫共四庫，第三庫保持恆溫5℃，第一、四庫保持恆溫-20℃、第二庫保持恆溫15℃，所有新進林木種子優先進行發芽率檢測工作。發芽率檢測委託農業部林業試驗所進行，以生長箱，設定30℃ 8小時配合光照，20℃ 16小時無光照，以仿照白天一晚之溫度及光照方式，每日24小時循環進行。
另有各庫溫濕度控制人機PLC介面，全天24小時監控各庫溫濕度。